Американская Radical Numerics сообщила о первом известном применении у человека бактериофагов, спроектированных при помощи искусственного интеллекта. Экспериментальную смесь вирусов ввели пациенту с устойчивой к антибиотикам бактериальной инфекцией, когда стандартные варианты лечения уже были сильно ограничены.

Но главная интрига пока остаётся без ответа. Компания подтверждает сам факт введения препарата, однако не сообщает, выздоровел ли пациент, улучшилось ли его состояние и возникли ли побочные эффекты. Причина, по её словам, в защите медицинской конфиденциальности.

Поэтому говорить о новой доказанной терапии ещё очень рано. Пока известно лишь, что ИИ смог помочь создать бактериофаги, которые дошли от компьютерной модели и лабораторных испытаний до реального пациента.

ИИ не придумал вирус с нуля — он переделывал существующий фаг

Бактериофаги — это вирусы, которые заражают бактерии. Для человека они сами по себе не являются привычными вирусными возбудителями: их мишень — конкретные бактериальные клетки.

Идея фаговой терапии существует больше века, но у неё есть серьёзная проблема. Один фаг может отлично уничтожать один штамм бактерии и почти не действовать на другой, поэтому для конкретного пациента приходится искать подходящий вариант.

Radical Numerics попыталась ускорить эту работу с помощью модели Omnii-1, обученной на генетических последовательностях и данных о взаимодействии фагов с бактериями.

В одном из экспериментов основой стал хорошо изученный бактериофаг T7 с геномом примерно из 40 тысяч пар оснований. Исследователи изменяли прежде всего ген gp17, связанный с белком хвостового волокна. Именно эта часть фага помогает ему узнавать рецепторы на поверхности бактерии и прикрепляться к ней.

То есть ИИ не создавал неизвестный организм совершенно с нуля. Модель предлагала изменения уже существующего фага и помогала отбирать варианты, которые с большей вероятностью сохранят жизнеспособность и смогут атаковать нужный бактериальный штамм.

Результаты лабораторного отбора выглядели заметно лучше случайного перебора. При 11–15 изменениях аминокислот удалось восстановить жизнеспособные фаги в 69,9 % предложенных Omnii-1 вариантов, тогда как у случайно изменённых образцов показатель составил лишь 4,8 %.

Из 6694 вариантов, активность которых удалось измерить, 2161 действовал лучше исходного T7.

Перед введением препарат проверили на бактерии самого пациента

Наиболее важный этап состоял в том, что врачи сначала выделили бактериальный штамм конкретного больного. Подобранный коктейль фагов испытали против него в лаборатории и получили необходимую активность.

После этого экспериментальную смесь ввели человеку по программе expanded access, или compassionate use. Такой механизм позволяет в исключительных случаях применять ещё не одобренное для массового использования лечение у тяжёлого пациента, если удовлетворительных стандартных вариантов практически не осталось.

Radical Numerics уточняет, что процедура проводилась по разрешённой FDA индивидуальной заявке Investigational New Drug и под медицинским наблюдением.

И вот здесь заканчиваются опубликованные данные.

Компания не раскрывает клиническое течение болезни после введения фагов. Поэтому пока можно подтвердить лишь две вещи: созданные с помощью Omnii-1 вирусы работали против бактериального изолята пациента в лаборатории и затем действительно были ему введены.

Из этого нельзя делать вывод, что ИИ уже научился лечить устойчивые к антибиотикам инфекции.

Есть и ещё одна оговорка. Заявление о «первом в мире» подобном применении исходит от самой Radical Numerics. Независимого клинического исследования с опубликованными результатами пока нет.

Тем не менее граница действительно пройдена важная. Ещё недавно ИИ-проектирование бактериофагов демонстрировали главным образом в чашках Петри. Теперь созданные с помощью модели варианты впервые, по заявлению разработчиков, дошли до реального пациента. Следующим куда более важным шагом должны стать открытые данные о безопасности и эффективности такой терапии.